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分子标记技术及其进展

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维普资讯 http://www.cqvip.com ( l按封3)15lTische rE.Mitchell R,HartmanT,d .The human genefor vascular∞一 dothelia fact ̄,nmhiple protein forms are encoded through alternative zxon spl ̄ing[J J.J.Bio1.a舢,1991,266:2603l一26037. 1l6 JKl/lg ̄llUl M,Damom PA. at0rs of angiogenesislJ J.Annu.Rev. Ph ̄ol,1991。53(2):217—239. [1 ]毛春明,杨晓.TGF一8在创伤愈合中的作用[J].军事医学科学院 刊,2∞l。25(3):232—235.  1l8 l Bicknell R。and Vallee B L.Angiogenesis s6mulates endot}1ebal cell prostacydin secretion by acfivati0n of phospholipase A2 lJ J.Proc.Nat1.A- cad.Sci.USA,1989,86:1573—1577. 1l9 JSrogi E,Wu T,d a/.Indirect angi ∞ic c ̄okines upmgulate、1EcF and bFGF gene expre ̄aion in va ̄ular smooth rrmscle cells,whereas h)13oxia upregu- lates VEGF expression onlyl J 1.Cirtadation,1994,90:649—652. [20]M ̄on JC,Lidin ̄on E A,Abroad SR,d a/.bFGF and、 GF s)aaergisti・ cally enhance endothelial cytoprotection via decav—accelerating factor induction ….Am J PtI 0Ⅱ,20(12,282:C578—587. 121 lPa呲i M,Herman IM.M∞h且nisrns of normal and tlm ̄or—derived angio- genesis lJ J.Am J PIly ,213132,282:947—970. }22 JSft'ilorl ̄PV,Guerrin M,Cholle P,d a/.Vasculotropin—V耐stimulares retinal capillary endothelial cell through all autocrine pathway lJ J.Inveset oph- thahn ̄Vis Sd,1994.35:3303一 l00. [23]龚晓敏,江时森.血管新生和动脉粥样硬化[J].中国循环,2001,5 (2):9l一93. 分子标记技术及其进展 收稿日期:2001—10—21:修回日期:2(1Y2—01—15 佳者算 :王志 fl界 婆博士 熬授 §一),男,硕士生。赵树进(1958一), ,代药理、中药。 主任药师,博士导,研究方向,神经生化,现 卫星或微卫星序列的完整性。另外,内切酶在基因组的其他 部位有较多酶切位点,则可使卫星序列所在片段含有较少无 关序列,性。分子杂交所用DNA控针核苷酸序列必须是小卫星序列或 通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的冬态 微卫星序列,通过分子杂交和放射自显影后,就可一次性检测 到众多小卫星或微卫星位点,得到个体特异性的DNA指纹图 谱[7l。 邶一次可检测到基因座位数可达几十个,同RFLP标 记一样,vNrR实验操作程序繁锁,检测时间长,成本耗费较 高[ 。 . 2基于PcR技术分子标记技术 2.1随机扩增多态性DNA(Random Ampliifed Polymorphism DNA RAPD) . , RAPD技术是由Williams[9j和Welsh[mJ同时发展起来的一 种新型遗体标记技术的。RAPD基本原理:它是利用随机引物 (一般为8~10bp)通过PcR反应非定点扩增DNA片段,然后 用凝胶电泳分析扩增产物DNA片段的多态性。扩增片段多态 性便反映了基因组相应区域的DNA多态性。RAPD所使用的 引物理各不相同,但对任一特定引物,它在基因组DNA序列上 有其特定的结合位点,一旦基因组在这些区域发生DAN片段 插入、缺失或碱基突变,就可能导致这些特定结合位点的分布 发生变化,从而导致扩增产物数量和大小发生改变,表现出多 态性。就单一引物而言,其只能检测基因组特定区域DNA多 态性,但利用一系列引物则可使检测区域扩大到整个基因组, 因此,RAPD可用于对整个基因组DNA进行多态性检测,也可 用于构建基因组指纹图谱。 与RFLP相比,RAPD具有以下优点:(1)技术简单,检测速 度快;(2)RAPD分析只需少量DNA样品:(3)不依赖于种属特 异性和基因组结构,一套引物可用于不同生物基因组分析; (4)成本较低。但RAPD也存在一些缺点:(1)RAPD标记是一 个显性标记,不能鉴别杂合子和纯合子;(2)存在共迁移问题, 凝胶电泳只能分开不同长度DNA片段,而不能分开那些长度 相同但碱基序列组成不同的DNA片段;(3)RAPD技术中影响 因素很多,所以实验的稳定性和重复性差_6J。 与RAPD技术类似的还有AP_-PcR(Arbitrary Primed PCR) 标记和DAF(DNA Ampliifed Fingerprints)标记。 2.1,1任意引物PcR(AP_-P( ) 在Ap__PER分析中,所使用的引物较长(10~50bp),PER 反应分为两个阶段,首先寡核苷酸引物在低严谨条件下与模 板DNA退火,此时发生了一些合成,以便稳定模板与引物之间 相互作用。然后进行高严谨退火条件的循环,两个位点问那 些序列在低严谨度退火条件下发生的引物延伸可继续在高严 谨条件下扩增Ll 。采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析PER 产物,最终反应结果与RAPD类似。 只要设计的引物在低严谨退火条件下能减少引物产生人 为产物,应用成对组合的引物可以产生新的Ap__PcR谱带,但 引物配对组合使用时,得到的图谱与单引物单独使用时产生 的图谱之和很不相同,这样,50个引物能产生(50)z/2=1 250 种不同指纹图谱Ll0J。 AP---PCR方法不需预知序列资料,而且检测的基因组样 本是任意的,AP__PCR还能够用于检测近等基因系(或同类 系)中的多态性【11]。AP--PER的缺点是每个新的多态性都必 须经纯化才能进一步使用。另外,此方法在杂合体中仅可辨 别长度多态性。 2.1.2 DNA扩增指纹(DAF) DAF是一种改进的RAPD分析技术,与RAPD技术不同的 是,DAF分析中所使用的引物浓度更高,长度更短(一般为5 8bp RAID .),因此它所提供的谱带信息比 大得多,如当使用5个核苷酸的引物时,引物和模板的组合大约可扩增出10~100 个DNA片段。PER扩增产物是在凝胶上进行分离,通过银染 即可产生非常复杂带型【 】。 2.2序列标志位点(STS) SIS是对以特定对引物序进行PER特异扩增的一类分子 记的统称。通过设计特定的引物,使其与基因组DNA序列 中特定结合位点结合,从而可用来扩增基因组中特定区域,分 析其多态性。利用特异PER技术的最大优点是它产生信息非 常可靠,而不像RFLP和RAPD那样存在某种模糊性。 (未完待续,见下期) ”’“ “ ” ’” ” “ ” ’“ ” “ ” “’ “◆“◆“ i期刊基本参数:CN23—1319/Q*1991*b*A4* 48 zh*P*¥5.50*35O0*35*2002—06 1 执行副主编:陈丽娟奚新伟责任编辑:奚新伟 网址:http:∥www.hljiam.com.CFI E—mail:swiwz. @l63.c0m 。 ◆lI◆JI◆+◆“.¨◆|l◆JI◆¨◆ l.¨◆¨◆JI◆¨◆¨.{◆1I◆“◆¨◆¨.¨. ◆ 

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