Early detection of molecular residual disease in localized
lung cancer by circulating tumor DNA profiling
Cancer Discovery
IF:20.010
研究策略及患者入组
研究策略
40例肺癌患者入组, 37例非小细胞肺癌, 3例小细胞肺癌; 7
例 IB 期, 33例 II-III 期;
共计 255 份血浆样本(术前基线和疗后不同随访节点) 进行
ctDNA 检测, 用于患者复发监测研究;
每次取血节点均进行 CT/PET-CT 检查;
CAPP-Seq (Cancer personalized profiling-Seq)(128 基因, 188kb)
基线血浆突变检出
37(93%)例肺癌患者基线期血浆中可检出基因突变, %腺
癌, 93%鳞 癌, 100%其他 NSCLC 和 SCLC;
平均每例患者可检测 5 个突变,中位突变频率 0.62%; 高频突变 Driver Gene TP53、KRAS 、KEAP1、EGFR 等;
37 例患者基线血检出 211个 SNV,18%为 driver
mutations,82%基 因突变检出为 Private/Passenger 突变;
基线血浆突变检出相关性因素
代谢肿瘤体积( Metabolic tumor volume)( Pearson r = 0.55, P =
0.0004 );
肿瘤分期 Stage I Vs II-III ( P = 0.002 );
疗后血浆突变检出 -多随访节点
疗后血浆突变检出
检测 37 例患者疗后多个随访节点血浆 ctDNA ,20 例( 54%)
患者至少 在一个随访节点中 ctDNA 检测阳性,这部分患者均复发( 100%);
突变检出分析, 35% Driver gene mutation,35% Passenger gene
mutatio,n 30% Both, driver/passenger gene mutation均 可预测患者
复发;
TP53、KRAS 、EGFR和 KEAP1 为高频检出突变基因
疗后多随访节点血浆突变检出
疗后/随访血浆( Any Post-treatment Time Point)ctDNA 检出与
Freedom from Progression (无进展期) 、 Disease-Specific Survival
(疾病相关生存率)
疗后血浆 ctDNA 检出与影像学比较
72%复发患者, ctDNA 分子复发早于临床复发(影像学) 5.2 个
月(中 位);
临床影像学评估可分为三类,无进展,可疑,复发; 37 例患者
227 次影
像学评估, ctDNA 分子检测灵敏度显著高于临床影像学;
Stage IIIB NSCLC,影像学检查,可疑, ctDNA 检查,阴性,患者未复
发
疗后血浆突变检出 -MRD LandMark
MRD LandMark (治疗后 4个月内血浆样本( first Post -treatment blood ))
32患者具有疗后 4个月内血浆样本, 17 例患者( 53%)MRD LandMark
ctDNA 阳性;
平均每例患者可检测 2 个 mutation ,中位突变频率 0.20%( 50%患者
MRD 检出少于术前血浆 mutation 检出数目);
MRD LandMark
17例 MRD LandMark ctDNA 阳性患者均复发( 100%); 仅
有一名 ctDNA MRD 检测阴性患者出现复发( LUP026);
ctDNA MRD 检测阴性 /阳性两组患者疾病进展及因病致死均
有显著差
异;
LUP026
ctDNA MRD 检出阴性;疗后 8 个月检测 ctDNA
阳性; ctDNA 检测结果与临床影像学一致
ctDNA 检测与 CT 检测比较
MRD LandMark 检测与免疫治疗
免疫检查点抑制剂
NSCLC患者外显子 >200 非同义突变,预示免疫检查点抑制剂疗
效较好; 癌组织小 Panel测序,可以用于推测患者 TMB ,但是 ctDNA 测序与 TMB 的关系并未证实;
利用 TCGA 数据库中 WES 数据与 CAPP-Seq 数据进行关联分析,
WES 与 CAPP-Seq 具有较好的关联性,且 Exome=41*CAPP-Seq;
5 例患者 WES 测序结果显示,测序结果与公式计算结果相符;
MRD LandMark 检测意义
疗后单节点 MRD ctDNA 检测意义在于能够及早的预测患者复发, 做到早治 疗,正确选择治疗方式
MRD ctDNA 检测, 20%患者使用 EGFR-TKI 药物,33%患者使用免疫疗
法, 47%患者使用化疗
患者 LUP20,81岁,stage IB,放疗疗效较好,但是 3 个月后
发现脑转 移;在 MRD 节点(疾病进展前),可检出 EGFR L858R 变异,预示该患者可能 使用 EGFR-TKI 药物获益
患者 LUP238,III 期肺鳞癌患者,通过 CAPP-SEQ 及计算公式,
预测全 外显子包含 331 个突变,经一线放化疗,病情完全缓解; MRD
ctDNA 检测阳性, 5个月后脑转移;该患者使用免疫疗法可能受益;
结论
检测 37 例患者疗后多个随访节点血浆 ctDNA ,20 例( 54%)
患者至少 在一个随访节点中 ctDNA 检测阳性,这部分患者均复发;
32例接受 MRD LandMark 血浆 ctDNA 检测的肺癌患者, 94%
(17/18) 复发患者 MRD LandMark 血浆 ctDNA 检测阳性;
一线治疗后 ctDNA 检测阳性(分子复发)较临床影像学复发早
5.2 个月 (中位值);
ctDNA 检测结 果 显示 ,53%患者疗后 Tumor Burden 较 低时使
用 EGFR-TKI 或免疫检查点抑制剂获益 讨论
术后 ctDNA 检测预测患者复发已在不同癌种中均有报道, 本文
使用疗后 ctDNA 检测预测早期局部肺癌复发, 灵敏度高于其他癌种及肺癌相关其他研究。 CAPP-seq技术在 ctDNA 检出中较可靠;
72%患者可检出 ctDNA 检测分子复发较临床复发早 5.2 个月,
有助于患 者 Tumor Burden 及异质性处于较低状态下进行介入治疗, 提高患者的预后水平; 使用 MRD Landmark ctDNA 检测对患者进行分层,不同基因型 /突变数目 患者使用不同治疗方案,实现更精准的治疗;
与 TRACERX 研究 19% 肺腺癌患者术前血浆 ctDNA 检出阳性相
比,此 研究肺腺癌患者术前 ctDNA 检出率高达 83%,这样的结果可能与此研究入组 I 期患者较少,且使用 CAPP-Seq ctDNA 检出率显著增高