国家劳动法规《工资支付暂行规定》中第十五条中明文规定，用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
1、用人单位扣代缴的个人所得税;
2、用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;
3、判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;
4、法律法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
这里的克扣指用人单位无理由扣减劳动者应得工资，不包括以下减发工资情况：
1、依法签订的劳动合同中有明确规定的;
2、用人单位依法制定并经过职代会批准的厂规、厂纪中明确规定的;
3、企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的;
4、因劳动者请事假应扣发的。
根据上述内容我们知道，单位不能对违纪员工罚款，因为其没有罚款的权利，也不能无故克扣员工的工资。但现实中，对违纪员工罚款或者是直接克扣员工工资的情况并不少见，有些单位罚款或者克扣工资的数额甚至于员工的基本工资相当，这无疑会损害员工的权利。
一、年底不结清工资是否合法
年底不结清工资是否合法需要根据具体情况确定。年底不结清工资，如果没到约定的结清期限，是合法的；如果超过了约定的结清期限，则是不合法的。
工资是指雇主或者法定用人单位依据法律规定、或行业规定、或根据与员工之间的约定，以货币形式对员工的劳动所支付的报酬。工资可以以时薪、月薪、年薪等不同形式计算。在中国，由用人单位承担或者支付给员工的下列费用不属于工资：
1、社会保险费；
2、劳动保护费；
3、福利费；
4、解除劳动关系时支付的一次性补偿费；
5、计划生育费用；
6、其他不属于工资的费用。
用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
1、用人单位代扣代缴的个人所得税；
2、用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
3、判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
4、法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
