年终奖个人所得税规定由于单位发放给员工的年终奖形式不同，个人所得税计算方法也不尽相同。
1、员工当月的工资薪金超过3500元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。但计算税额时，速算扣除数只允许扣除一次。
2、员工当月的工资薪金不超过3500元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。年终奖个人所得税=(年终奖-(3500-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(3500-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。但可以将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，作为应纳税所得额。其中“雇员当月工资薪金所得”以收入额扣除规定标准的免税所得(如按规定缴纳的社会保险和住房公积金等)后的数额。
3、员工一个年度在两个以上单位工作过，只能按照国税发[2005]9号文件规定，在一个纳税年度内，对每一个纳税人年终奖计税办法只允许采用一次，纳税人可以自由选择采用该计税办法的时间和发放单位计算。该条款的要点是：
(1)一个员工2013年1月发放的年终奖适用了除以12找税率的优惠计算，2013年其它月份就不能再适用了。
(2)一个员工一年一次，在两处以上取得年终奖，也只能适用一次。
(3)员工即使工作时间不足12个月，也可以适用一次。
4、员工同一月份在两个以上单位取得年终奖，可以选择一个单位的一次性奖金按照国税发[2005]9号文件规定：“在一个纳税年度内，对每一个纳税人，该计税办法只允许采用一次”的优惠办法进行计算。也就是说，从另一单位取得的年终奖合并到当月工资薪金项目缴税。如果同一个人同月在两个企业都取得了年终一次性奖金，纳税人在自行申报时，不可以将这两项奖金合并计算缴纳个人所得税，享受一次性奖金的;对该个人按规定只能享受一次全年一次性奖金的优惠算法。
