配合机关调查是否会对公司的经济利益造成影响？

法律分析：配合机关的调查是企业作为社会成员应尽的义务，但也有可能对企业经济利益造成影响。

法律依据：

1.《中华人民共和国公司法》第七十三条企业应当遵守法律、行规和规章制度的规定，接受监督检查。

2.《中华人民共和全生产法》第九十六条，企业应当加强安全生产监督管理，并对部门的安全生产监督检查和人民群众对安全生产的监督检举配合、接受和处理。

3.《中华人民共和国刑事诉讼法》第八十一条，机关调查刑事案件，有权向被调查人、证人和被害人了解有关情况，并查询、抄录有关证据材料。被调查人、证人和被害人应当如实回答问题，提供证据材料。

4.《中华人民共和国民事诉讼法》第十二条，公民、法人或其他组织享有提起诉讼的权利，并有义务依法履行诉讼程序。

5.《中华人民共和国公司法》第七十四条，企业应当按照国家有关规定履行纳税义务、社会保险义务和其他法定义务。

综上所述，企业应当配合机关的调查，并严格遵守法律法规的规定，以维护企业的合法权益，也须履行企业的法定义务，避免对经济利益造成影响。